La disciplina per l’accreditamento iniziale e periodico dei Corsi di dottorato delle università prevede modalità e strumenti diversi di attuazione.

L’accreditamento iniziale dei corsi consiste nell’autorizzazione da parte del MUR, conformemente alla valutazione dell’ANVUR rispetto alla qualificazione scientifica del Collegio di dottorato, al progetto formativo e ai servizi/risorse per gli studenti.

L’accreditamento periodico consiste principalmente nella verifica della permanenza dei requisiti che hanno condotto all’accreditamento iniziale dei Corsi e si svolge ogni cinque anni, o in caso di modifiche sostanziali del corso (es. composizione Collegio, cambio del Coordinatore o della denominazione del Corso). 
I Corsi di dottorato sono altresì valutati in sede di accreditamento periodico degli atenei, dove si procede a verificare il sistema di assicurazione della qualità dei corsi.